機耕船在農業得到應用，其行駛注意事項表現在以下方面：

①作好出車前的準備工作，加足燃油，潤滑油，冷卻水，緊固各聯接部位的螺栓，調整各部位間隙或皮帶張緊度。

②在工作過程中，駕駛員謹慎駕駛，注意聽發動機有無異常聲音，否則，停車檢查。

③注意發動機的機油壓力指示器,應在正常位置并無上下竄動現象，否則，停車檢查。如機油濾清器堵塞，機油泵壓力不夠等，應及時排除。

④與機耕船配套的柴油機，其冷卻方式為循環式，柴油機在工作一段時間后，就如有開鍋現象，冷卻水也隨之因蒸發而減少，冷卻水減少，駕駛員應隨時添足，但切忌不要因柴油機開鍋，機車溫度高，將水箱中的水全部放掉，再猛添加冷水，這樣會導致柴油機機體缸套、缸蓋等零部件局部位置冷熱不均而產生炸裂。

⑤不允許機耕船柴油機超額定負荷工作，因柴油燃燒不完全，產生大量的積炭，有可能將柴油機噴油嘴、活塞環等零部件燒死。

⑥不允許機耕船超額定轉速工作，否則，會加劇部分零部件的磨損，同時導致駕駛員過度緊張，有發生事故的隱患。

⑦機耕船在上下坡時，嚴禁大油門，禁止機耕船在大于25°的坡地上行駛或停車。

⑧機耕船在行駛過程中，禁止用鐵驅動輪在公路或碎石路面上行駛。

⑨無特殊情況，禁止機耕船在田間急轉彎，以免損壞機具零件和農具。